食醋具有很强的杀菌能力，它可以杀灭肠道中的葡萄球菌、大肠杆菌，有效预防痢疾等肠道疾病的发生。1996年，引起大批小学生食物中毒的致病大肠杆菌O-157菌在日本肆虐。名古屋大学医学部分别用酸度10％的酒精醋、酸度4．2％的杂谷醋和酸度4．5％的米醋杀灭O-157菌。实验证实。使用酒精醋1分钟、杂谷醋60分钟、米醋120分钟后就能使O-157菌数量降低至十万分之一。生活中，食醋对芽胞杆菌、微球菌属（是最为常见、分布也十分广泛的食物腐败菌）、金黄色葡萄球菌（细菌性食物中毒最主要的病菌之一）和病原性大肠杆菌等菌种有完全抑制其繁殖的作用。

食醋抗病毒最直接的证据是防治感冒。在酿造食醋的工厂里，工人们很少患感冒。学者们认为这与他们长期接触食醋有很大关系。感冒病毒的生长主要靠核糖核酸酶系统的催化作用，而核糖核酸酶等又受酸碱度、温度、微量金属离子的控制。一般病毒生长环境的pH值为6．5～7．9，用5％～6％的食醋液，其氢离子或氧离子浓度足以控制所有感冒病毒的生长。经临床检查，有效率为92％～97％。因此，在日常生活中，如遇感冒流行，不妨用食醋熏蒸，其方法是：取适量醋（每立方米空间2～10毫升），用1～2倍水稀释，以温水加热熏蒸。

食醋对癣等多种真菌也有很强的杀灭能力。脚气病起因于一种叫做白癣的真菌，这种病菌附着在皮肤上繁殖，生长在趾间就导致脚气病，瘙痒也是由它引起的。日本九州大学的矢野宽、猿田隆夫两位博士，经研究证明白癣菌分别在稀释10倍和100倍的醋、醋酸水溶液中会停止繁殖，浸泡20分钟后可导致该真菌死亡。因此，一般情况下用食醋坚持泡脚1周即能治愈脚气病。